Skriva ting

Eg m skriva labjournal. Og det er ikkje alltid like kjekt. Trur det vert betre nr eg kjem i gang, men nett no berre gruar eg meg.

Me har identifisert 4 av 5 bakteriar! Hurra!

Dei utleverte:
8a- Escherichia (basert p klassiske testar og at koloniane vres ikkje er gule og dermed ikkje br vera Enterobacter
8b- Bacillus (basert p klassiske testar OG 16S rDNA sekvensering. Best treff p B.subtilis, men skal vistnok vera B.megaterium, som me har 92% treff p. Men Bacillus er spass like i 16 S, at me eigentleg berre kan skilja p om det er cereus-gruppa eller subtilis gruppa...

Dei me har sjlv isolert fr laks:
KPG-A Pseudomonas (klassiske testar snevra inn p denne og to-tre andre. 16S rDNA-sekvensering gav oss hg treff p Pseudomonas fluorescens
KPG-H Her har me fleire alternativ, s me fr ikkje snevra den inn noko serleg.
R2A-A1 Alcaligenes. Basert p klassiske testar sat me att med denne og Halobacterium. Men Halobacterium. tilhyrer archea, og ikkje prokarya, og er dessutan s halofil (saltelskande) at den ikkje burde vekse srleg p vras medium. Er ikkje sikker p om det gjeld for alle artar i genus Alcaligenes, men dei er opportunistisk patogene \o/

Skriv om :

Isolering av bakteriar
Platespreiing
Cfu
Reindyrking
Klassiske testar:
-mikrosopering
-gramfarging
-KOH-test
-Gram-negativ-spesifikk antibiotikatest som ikkje fungerte
- fermentering/oksydering av karbohydrat
-flagellfarging
-katalasetest
-oksidasetest
-kasein hydrolyse
-gelatin hydrolyse
-lipid hydrolyse
-Nitratreduksjon
-Anaerob?


Kommersiell test:
-BIOLOG (men maskina er ydelagd, s me fr ikkje lest av platene vras)

Molekylre testar
16S rDNA sekvensering
- isolering av DNA
-elektroforese av isolert DNA
-PCR amplifikasjon av 16S rDNA
-Elektroforese av produkta
-Reinsking av produkta fr gelen
-sekvensering (som vart gjordt eksternt)
-Samanlikning av 16S rDNA sekvensen med andre sekvensar i databasar

Og ein heil del til om
MILJMIKROBIOLOGI!

Vr homofile bakterie:

Ok, s passar det ikkje heilt, men det er ikkje langt fr :P

Ingen kommentarer

Skriv en ny kommentar

Kari Lovise

Kari Lovise

23, Bmlo

Bioteknologi? Oi! Da e sikkert gy! Leikar meg med gener, bakteriar, sopp og kjemiske stoff p Universitetet for milj-og biovitenskap p s.
Eg lese bke, spele klarinett,sitte litt for mykje p internett, er med venner og har det generellt ganske bra :)

myspace visitor counter

Kategorier

Arkiv

hits